南京理工大学知识产权学院成立于二00五年七月，由南京理工大学和江苏省知识产权局合作建立，是江苏省第一家知识产权学院。2013年9月工业和信息化部、江苏省人民政府、国家知识产权局在北京正式签署共建南京理工大学知识产权学院协议，是全国第一个由三家省部级单位共建的知识产权学院。共建三方将以知识产权学科为龙头去建设一个“国际知名、全国一流、特色鲜明、充满活力”的知识产权学院。知识产权学院院长由南京理工大学校长王晓锋教授兼任。国家知识产权局原局长田力普、中南财经政法大学原校长吴汉东担任名誉院长。2014年2月28日，南京理工大学知识产权学院首届理事会成立并揭牌运行，学院的建设发展跨入了一个崭新的阶段。

南京理工大学知识产权学院是南京理工大学下属二级学院，由工业和信息化部、国家知识产权局、江苏省人民政府共同建设，南京理工大学直接管理。知识产权学院的建制方式和运行模式实行理事会指导监督下的院长负责制